W roku 2000 Gates również jego żona założyli Bill & Melinda Gates Foundation. Znaczny wpływ na to miała szczodrobliwość plus wielka dobroczynność Davida Rockefellera. Bill Gates oraz jego wapniak spotkali się z poprzednio kilkanaście razy.[45].
Fundacja zapewnia środki na stypendia naukowe na rzecz słabo reprezentowanych mniejszości, zapobieganie AIDS także innym chorobom powszechnym do wnętrza krajach trzeciego świata także na inne dobroczynne cele. W 2000 Fundacja Gatesów wspomogła Uniwersytet Cambridge 210 milionami dolarów do wykorzystania w środku ramach projektu Gates Cambridge Scholarships. Fundacja podarowała też wokół 7 miliardów dolarów na różne cele, wewnątrz tym milion milionów na United Negro College Fund. Według artykułu magazynu Forbes z 2004, Gates przekazał w środku latach 2000-2004 na cele charytatywne z okładem 29 miliardów dolarów. Jego darowizny są zwykle przytaczane jak wywołujące pokaźną zmianę wewnątrz nastawieniu bogatych ludzi do filantropii, która zaczęła wydawać się się wśród nich normą.[46]